Ďalším lákadlom Cordoba - San Francisco Cirkvi, ktorá je jedným z takzvaných "ferdinandovskih" kostolov, dostal svoje meno z toho, že boli medzi prvý kresťanský kostol postavený v Córdobe po reconquest od Moors kráľom Ferdinandom III. Akonáhle kostol bol postavený v časti 13. storočí kláštor San Pedro el Real. Kláštor, ktorý patril k františkánskym náboženskej komunity byť dosť blízko na čas a mal veľký vplyv v náboženskom živote mesta. Je známe, že v 17. storočí tu žilo sto mníchov, a väčšinu z jeho prosperity a vplyvu že dosiahol v 18. storočí. Ale v začiatku 19. storočia, v priebehu vopred Napoleonových vojsk bol kláštor zničený, a kostol San Francisca ako zázrakom prežila.

Pôvodne vytvorený v gotickom slohu, dnes budova kostola San Francisco je len čiastočne podobá pôvodnú štruktúru. V priebehu 18. storočia bol objekt obnovený niekoľkokrát a jeho priečelie je mnoho prvkov, baroka, podstatne zmenila stredovekú podobu kostola.

V súčasnej dobe, kostol San Francisco je nielen jedným z najstarších, ale tiež jedným z najbohatších kostolov v Cordoba. Obsahuje veľké množstvo kultúrnych hodnôt akumulovaných od stredovekého obdobia. K dispozícii je tiež zaujímavá zbierka obrazov umelcov 18. storočia Cordova. To si zaslúži osobitnú pozornosť a jemné dobovým nábytkom, ktorý sa nachádza v priestoroch chrámu.