Prehliadka Ueno parku nutne viesť hosť japonského kapitálu v Národnom múzeu prírodnej histórie, ktorý sa nachádza v severovýchodnej časti parku. Expozícia zahŕňa viac ako 14 tisíc exponátov a hovorí o vzniku sveta všeobecne a najmä na japonskom súostroví, rovnako ako o zmenách, ku ktorým došlo v ich histórii od počiatku až po súčasnosť.

Múzeum bolo otvorené v roku 1871 a od tej doby vystriedalo niekoľko mien - to bolo Ministerstvo školstva a múzeum a múzeum v Tokiu, zatiaľ čo v roku 2007 nezískala jeho súčasný názov. V neskorej dvadsiate storočie a na začiatku tohto storočia, múzeum prešlo modernizáciou. Jej hlavná budova bola vyhlásená za kultúrne dedičstvo národa, to je teraz japonská galérie, tam je tiež 3D kino "Theater 360". Nová budova múzea je otvorené Celosvetová galérie. Pred vstupom múzeum inštalovaný postavu modrej veľryby v plnej veľkosti.

Šesť poschodí Celosvetová galérie hovoriť o vývoji života na Zemi, zákonov prírody, pôvod dinosaurov a druhovej rozmanitosti. Samostatné oddiely sú venované na rozvoj vedy a techniky, a zástupcovia sveta zvierat. Na záhrade je umiestnený na streche galérie, rastúce asi 160 druhov liečivých a aromatických bylín, a tam sú slnečníky, ktoré sú popísané v prístupe človeka k nim. V galérii, návštevníci sú zatiaľ držať alebo získať fyzický zážitok do interaktívneho dreva.

Japonský galérie sa nachádza v budove bývalej hlavnej budove, postavený v roku 1930. Tu je to, čo bolo japonské súostrovie v dobe ľadovej, môžete vidieť zbierku minerálov, meteoritov, fosílií, dozvedieť sa o zvieratá obývajú ostrovy súostrovia, aby zistili, čo boli poľnohospodárske stroje s. Samostatná časť je venovaná úlohu ryže v živote Japonska.

3D kino "Theater 360", ktorý sa nachádza v rovnakej budove, bol odovzdaný do múzea po skončení medzinárodnej výstavy "Expo-2005", kde bol prvýkrát predstavený návštevníkom pavilónu Japonska. Toto sférické bezšvové obrazovka s priemerom 12, 8 metrov. Táto veľkosť bola zvolená: postava - asi milióntinu priemeru našej planéty. Číslo 360 v mene kina je zorný uhol. Publikum v kine v strede gule, a jeho dome filmy premietané na pôvod vesmíru, dinosaurov a kontinenty. Štyri z nich boli vytvorené pracovníci múzea.