V roku 1220, krajina Okolie obce Padise, bola daná do kláštora Dyunamyunde (Daugavgriva dnes na území v Rige) ako odmenu za to, že k tomuto kláštor pomohol viesť k viere a krst miestnych obyvateľov. Možno predpokladať, že to bola pôvodne postavená kaplnka (kaplnka), ktorý bol považovaný za kameň. Prinajmenšom existujú dôkazy, že v roku 1310 pán mnísi požiadal dánsky kráľ Eric Menveda povolenie postaviť kamenné budovy. Pre rozvoj náboženského života obce a kaplnka služby sem poslali niekoľko mníchov.

V roku 1317 začala aktívne výstavba cirkevných stavieb v Padise. U diel používaných vazalemmaysky mramorové balvany a neskôr. Kamenný múr obklopujúci masívne kláštorné budovy, v závislosti na reliéfe a nasledoval riečneho koryta. Vývoj kláštora boli pozastavené roku 1343, v noci pod svätého Juraja deň, kedy povstanie Estónci. Potom, podľa kroniky Hermanna Vartbergskogo, 28 mníchov bolo zabitých a perfektné zapálil budov. Po povstaní Dánsko dal severnej Estónsko na Livonského poriadku.

Cisterciáni viedol asketický život, nemali jesť mäso. Cisterciáni - katolícky rehoľný rád, ktorý v 11. storočí oddelený od benediktínskeho rádu. Pre cisterciánov typické kontemplatívny, asketický život. Kostol rádu sa vyznačujú úplnou absenciou luxusné interiéry, vzácny šperk, maľovanie. Objednať stal sa tak vplyvný a dobre známe, že v 13. storočí ich bolo už asi 200 kláštorov, a na začiatku 14. storočia sa ich počet zvýšil na 700. Na počesť svätého Bernarda z Clairvaux, ktorý hral významnú úlohu v rozvoji Rádu, majster vyrezávané na cirkev kameň konzole obraz svätca sa symbolom vernosti - psa. Cisterciáni vytvoril Padise rybolovu, ktorý zahŕňal niekoľko rybníkov. Najvyššia úsvit kláštor dosiahol v roku 1400.

Po Livonian vojne, väčšina z kláštorných budov bolo zničených. Je známe, že počas vojny opát bol sťatý. Od tej doby, legenda duch mnícha, ktorý tu žije, ktorý sa môže zdať ľuďom kedykoľvek počas dňa alebo v noci.

Dnes je zrúcanina kláštorného Padise prešiel čiastočnou rekonštrukciu. Murivo zachovaná z ďalšieho ničenia. Kláštor je otvorený pre voľné prezeranie. Lodenice a budova kláštora je často využívaný pre predstavenia, koncerty a svadby.