Zoo a múzeum prírody v Splite bol venovaný mesta vďaka počiatku XX storočia, niekoľko cenných prírodných zbierok. Profesor Umberto Dzhirometta v roku 1923 vzniesol otázku vytvorenia Museum of Natural History. Mestská rada Split sa v tejto veci k preskúmaniu, a v roku 1924 založil prvé múzeum a Dzhirometta stal sa jeho vodcu až do svojej smrti v roku 1939.

V prvých rokoch svojej existencie, bolo múzeum sa nachádza v jednom z mestských budov v centre mesta. Čoskoro priestor nebolo dosť, a bolo múzeum sa sťahoval do jednej z budov Marjan parku. Spolu s múzeom otvoril malý zoo, ktoré predstavujú niektoré druhy domácich i exotických zvierat. Pre prvý v bývalej Juhoslávii Aquarium vedľa budovy múzea bol postavený ďalší priestor. O niekoľko rokov neskôr, oceanárium bola uzavretá a premenený na malé klietke. Dnes v Splite Zoo má viac ako 300 druhov zvierat.

Budova v Marjan parku na nepriateľských akcií v roku 1991 bola uzavretá z bezpečnostných dôvodov. Potom, múzeum presťahoval sa do pevnosti reptania, a po roku 1997 sa vrátil do Marian. Po roku 2000 sa na žiadosť zamestnancov pre potreby múzea bolo pridelené nový priestor, o celkovej ploche cca 1156 metrov štvorcových, v ktorých múzeum začal pracovať v januári 2002.

Pred otvorenie nového riaditeľa múzea bol reorganizovaný múzejných zbierok a líčil niekoľko nových expozícií (napr zbierka vypchatých zvierat a vtákov, odboru geológie a paleontológie, entomológia, Katedra stavovcov a bezstavovcov, etc.). Rovnako boli vykonané práce na spracovanie a systematizácia exponátov, terénne práce v centrálnej časti Dalmácie, početné výstavy v múzeu i mimo neho. Okrem toho, zamestnanci múzea podieľa na mnohých vedeckých konferencií.

V prízemí múzea hostí celý rad výstav, a na ostatných podlažiach domu stálu expozíciu. Každý si môže kúpiť múzejnej ďalšie materiály o histórii múzea a miestne prírodné histórie.