Kostol San Miguel (San Miguel Church), bola postavená v 1630 v Manile ako uznanie španielskeho generálneho guvernéra, ktorý tesne unikol smrti v čase vojenskej kampane. Cirkev tiež pomoc a podporu japonských kresťanov, ktorí utiekli pred prenasledovaním v priebehu feudálneho režime Tokugawa shogunate. Vzhľadom k tomu, mnoho z týchto exulantov boli bojovníci samuraja, tj, kostol bol zasvätený archanjela Michaela (alebo Miguel Svätým v španielčine), veľkého mučeníka. Súčasný kostol, známy pre svoje úžasné symetrické zvončeka-dvojčiat, postavený v štýle európskeho baroka. Nachádza sa v blízkosti vládneho paláca Malakanang a je povinnou súčasťou programu exkurzie. Pred kostolom je rozdelená pomerne malé námestie s tropickými stromami a kvetmi a fontánami, ktorý harmonizuje dobre s cirkevné stavby.