Botanická záhrada bola postavená v rokoch 1772-1774. Takmer okamžite po svojom založení spojené s Národnom múzeu, tvorca, ktorý bol markíz Pombal. Miesto Garden zvolený Vice-kancelár univerzity v Coimbre, Francisco de Lemos. Na záhrade sa nachádza na pozemku, ktorý patril do školy sv Bento, umiestnenie, ktorá bola Ursulines Valley. Prvý kurátor záhrady bol Domingos Vandella, a v roku 1791 bol nahradený Felik Alevar Brotero, profesor botaniky a poľnohospodárstvo. V záhrade sa neustále rozširuje, tam boli nové vzorky rastlín, a v okamihu, keď záhrada sa rozkladá na ploche 13 hektárov.

Botanická záhrada Univerzity v Coimbre je jednou z najkrajších záhrad v Európe a skladá sa z dvoch častí. Jedna časť sa nachádza na kopci a je rozdelená do terás. Dolná terasa sa volá Kvadrado Central a je najstaršia časť záhrady. Terasa je vyzdobený s fontánou 40s, môžete vidieť stromy zasadené v dňoch Felix Brotero vikár záhrady. Elementy zdobenie terasy majú veľa spoločného s dekorom európskych záhrad v XVIII storočia. Na inej terase si môžete prezrieť skleníky s tropickými a subtropickými stromami a kvetinovými záhonmi celých rodín rastlín. Tieto rastlinné lôžok rozdelených do skupín taxonomicky a sú pestované pre použitie študentov, botaniky, ako aj k výmene s inými podobnými inštitúciami po celom svete, ktorý má botanickú záhradu.

V druhej časti záhrady sa rozkladá nad údolím, cez ktorý tečie malý potok, a kde sa nachádza arborétum. Je tu veľa rastúcich bambusových stromov a iných exotických rastlín. Tiež druhá časť záhrady je známy pre svoje vynikajúce zbierku eukalyptu (51 druhov). V záhrade živej hydiny. Rodiny hnedý veveričky sú súčasťou ekosystému, ktorý bol úspešne zavedený v júni 1994. Proteíny boli prvé zvieratá, ktoré sú dobre prispôsobené pre životné prostredie a začal sa množiť.