Katedrála Arequipa je jednou z najstarších cirkevných stavieb v meste. Prvý kostol bol postavený v roku 1544 architektom Peterom Godinez pod záštitou biskupa Cuzco, Don Fray Vicente de Velarde. V roku 1583 zemetrasenie zničilo chrám. V roku 1590 bola obnovená stavba kostola, ale nie na dlho. V roku 1600, vzhľadom k vulkanické erupcie Huaynaputina, bol kostol čiastočne zničené znova. Na začiatku storočia XVII, Pavol V. založená Diocese Arequipa, a na mieste starého kostola z roku 1621 do roku 1656 bolo postavené na katedrálu. Po ťažkom požiari v roku 1844 budova katedrály boli schopní obnoviť architekta Lucas Pobla a s podporou biskup Jose Sebastian de Goyenesh a Barreda v roku 1868.

V júni roku 2001, mesto Arequipa bol poškodený pri zemetrasení 8, 1 na Richterovej stupnici. Jedna veža katedrály bola úplne zničená, hlavná loď, klenby a druhá veža bola ťažko poškodená. O rok neskôr, v jeho výročia, katedrála kompletne prestavaný pod vedením Juan Manuel Guillen.

Katedrála je postavená vyčistených sopečného kameňa a tehál v novorenesance s nejakým gotickým vplyvom. Hlavný chrám mesta sa nachádza na severnej strane námestia Plaza de Armas, historického centra mesta Arequipa. Jeho fasáda je zložená z sedemdesiatich stĺpy s korintskými hlavicami, tromi dverami a dvoma veľkými bočnými oblúkmi.

Oltár chrámu je z carrarského mramoru, dielo Felipe Maratillo. Unikátny predseda vyrezávaného duba robil francúzsky umelec Rigo korálky z Lille. V múzeu katedrály ukladá vzácnych umeleckých diel vyrobených v Španielsku umelca-klenotník Francisco Maratillo, Strieborná koruna Elizabeth II a mnoho ďalších artefaktov darovali radou biskupov Goyeneshem a jeho rodiny.